Innbyggere i Sør-Sudan har muligheten til å ta høyere utdanning i enten et universitet eller en yrkesskole. Selv om det er en mangel på begge institusjoner, flere programmer er på plass for å utvide dagens landskapet i høyere utdanning i Sør-Sudan.

Kursene er akademiske klasser undervises av kvalifiserte instruktører som er ment å forbedre deltakernes kunnskap om et gitt område eller opplæring i en bestemt disiplin. Kurs variere bredt når det gjelder lengde, størrelse, innhold og varighet.